A história do Núcleo UFRJ Mar em Cabo Frio começa em outubro de 2005, quando a cidade sediou o 6o Festival UFRJ Mar. Desde então, outras cinqo edições do evento foram realizadas na cidade.
O Festival vem demonstrando para o governo Municipal e para a comunidade local as possibilidades de ações permanentes, que vem sendo discutidas desde 2006. Entre essas ações constam: a criação de programas para professores da rede pública de ensino, de um Colégio Politécnico, de uma Marina Escola, de uma Estação de Oceanografia e Aqüicultura e a criação de um Centro Vocacional Tecnológico (CVT) voltado para a Pesca, para a indústria náutica e para o turismo.
Em maio de 2007, durante o 9o Festival UFRJ Mar, fortaleceram-se os laços com o poder público local: a prefeitura cedeu uma área de 10.000 metros quadrados para a instalação de laboratórios e da sede do CVT, onde planeja-se construir a Estação de Oceanografia e Aqüicultura de Cabo Frio.